Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Stx18Q8VDS8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx18Q8VDS8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms