Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rdh10Q8VCH7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rdh10Q8VCH7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rdh10Q8VCH7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rdh10Q8VCH7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rdh10Q8VCH7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rdh10Q8VCH7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms