Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ApobrQ8VBT6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ApobrQ8VBT6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms