Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT1

Txlnb, Beta-taxilin, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnbQ8VBT1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TxlnbQ8VBT1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms