Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnaaf4Q8R368 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnaaf4Q8R368 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms