Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sf3b4Q8QZY9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b4Q8QZY9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms