Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5C8

Rdh9, Cis-retinol/androgen dehydrogenase type 3, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh9Q8K5C8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rdh9Q8K5C8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rdh9Q8K5C8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms