Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lin28aQ8K3Y3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms