Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssh3Q8K330 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Ssh3Q8K330 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Ssh3Q8K330 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssh3Q8K330 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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