Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd2Q8K2Z4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms