Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrdQ8K2M3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrdQ8K2M3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrdQ8K2M3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrdQ8K2M3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrdQ8K2M3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrdQ8K2M3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrdQ8K2M3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrdQ8K2M3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrdQ8K2M3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms