Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2K6

Agfg1, Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agfg1Q8K2K6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Agfg1Q8K2K6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Agfg1Q8K2K6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms