Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cnppd1Q8K158 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cnppd1Q8K158 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cnppd1Q8K158 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnppd1Q8K158 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Cnppd1Q8K158 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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