Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne5Q8JZW4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms