Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prmt5Q8CIG8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prmt5Q8CIG8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms