Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mterf1aQ8CHZ9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mterf1aQ8CHZ9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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