Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Csnka2ipQ8CH19 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Csnka2ipQ8CH19 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Csnka2ipQ8CH19 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Csnka2ipQ8CH19 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Csnka2ipQ8CH19 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Csnka2ipQ8CH19 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Csnka2ipQ8CH19 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Csnka2ipQ8CH19 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csnka2ipQ8CH19 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Csnka2ipQ8CH19 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Csnka2ipQ8CH19 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Csnka2ipQ8CH19 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnka2ipQ8CH19 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Csnka2ipQ8CH19 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Csnka2ipQ8CH19 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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