Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifnl3Q8CGK6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifnl3Q8CGK6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms