Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Nedd4lQ8CFI0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Nedd4lQ8CFI0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd4lQ8CFI0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Nedd4lQ8CFI0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Nedd4lQ8CFI0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Nedd4lQ8CFI0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Nedd4lQ8CFI0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Nedd4lQ8CFI0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Nedd4lQ8CFI0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Nedd4lQ8CFI0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nedd4lQ8CFI0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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