Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkl1Q8CEQ0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms