Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Usp27Q8CEG8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp27Q8CEG8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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