Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms