Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pramef8Q8CE24 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pramef8Q8CE24 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
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Pramef8Q8CE24 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Pramef8Q8CE24 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef8Q8CE24 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef8Q8CE24 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef8Q8CE24 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pramef8Q8CE24 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pramef8Q8CE24 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramef8Q8CE24 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.1 ms