Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc63Q8CDV6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms