Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc178Q8CDV0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc178Q8CDV0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms