Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rsph6aQ8CDR2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph6aQ8CDR2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph6aQ8CDR2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph6aQ8CDR2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph6aQ8CDR2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rsph6aQ8CDR2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms