Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Lrif1Q8CDD9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Lrif1Q8CDD9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Lrif1Q8CDD9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Lrif1Q8CDD9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Lrif1Q8CDD9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Lrif1Q8CDD9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrif1Q8CDD9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Lrif1Q8CDD9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Lrif1Q8CDD9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrif1Q8CDD9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Lrif1Q8CDD9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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