Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf31Q8CCF0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf31Q8CCF0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf31Q8CCF0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf31Q8CCF0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf31Q8CCF0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf31Q8CCF0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms