Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9U4

Gm9958, MCG147145, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9958Q8C9U4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm9958Q8C9U4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm9958Q8C9U4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms