Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vwc2Q8C8N3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vwc2Q8C8N3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms