Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoa5Q8C7G5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa5Q8C7G5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms