Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apol7cQ8C6E1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apol7cQ8C6E1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms