Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ttc21aQ8C0S4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc21aQ8C0S4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms