Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec22cQ8BXT9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms