Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdsp2Q8BX07 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms