Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pggt1bQ8BUY9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms