Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nup54Q8BTS4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms