Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT42

Smim5, Small integral membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim5Q8BT42 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smim5Q8BT42 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smim5Q8BT42 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms