Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI4

Gen1, Flap endonuclease GEN homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gen1Q8BMI4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gen1Q8BMI4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms