Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms