Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan12Q8BKT6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms