Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D130040H23RikQ8BII3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
D130040H23RikQ8BII3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms