Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vipas39Q8BGQ1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Vipas39Q8BGQ1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Vipas39Q8BGQ1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Vipas39Q8BGQ1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Vipas39Q8BGQ1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Vipas39Q8BGQ1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Vipas39Q8BGQ1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Vipas39Q8BGQ1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Vipas39Q8BGQ1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Vipas39Q8BGQ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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