Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atg4bQ8BGE6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4bQ8BGE6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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