Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm2Q8BGA3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms