Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2-M10.4Q85ZW8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms