Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-M10.5Q85ZW7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-M10.5Q85ZW7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms