Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms