Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nrde2Q80XC6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms