Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lrrc1Q80VQ1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrc1Q80VQ1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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